[Научно-популярное, Биотехнологии] Биологи полностью расшифровали геном енотовидной собаки
Автор
Сообщение
news_bot ®
Стаж: 6 лет 9 месяцев
Сообщений: 27286
Исследователи из Политехнического университета Валенсии и Университета страны басков смогли аннотировать полный геном енотовидной собаки. Известно, что этот вид является переносчиком многих заболеваний, которые могут поражать человека, включая Covid-19. 
Енотовидные собаки (Nyctereutes procyonoides), близкие родственники лисы (Vulpes vulpes) произошли из Восточной Азии, а в 1940-х годах были завезены в Европу. Хотя самые южные популяции, обнаруженные на данный момент, находятся во Франции, исследования предсказывают, что животные могут поселиться на Пиренейском полуострове в течение следующих 20 лет. Это имеет большое значение с точки зрения общественного здравоохранения, поскольку, как известно, енотовидная собака является переносчиком множества заболеваний, которые могут поражать людей, включая коронавирус. Для расшифровки генома использовались долгое секвенирование третьего поколения (PacBio и Oxford Nanopore Technologies) и методы биоинформатики. Основная проблема заключалась в сложной хромосомной структуре вида, которая характеризуется наличием необычно больших теломер и центромер, а также различного количества хромосом B-типа. Все эти элементы характеризуются некодирующими повторяющимися участками ДНК, которые очень трудно секвенировать и впоследствии изучать. Размер полученного генома составляет 2,39 гигабаз, в нем идентифицировано и аннотировано более 27 тысяч генов. Кроме того, 39 % собранного генома состоит из повторяющихся областей. 
b) Естественный (оранжевый) и нынешний и прогнозируемый (фиолетовый) ареалы обитания енотовидной собаки. c) Рабочий процесс сборки и аннотации генома. d) График, показывающий глубину охвата генома считыванием, GC-состав и размер охвата. e) Синтения генома, полученная с помощью инструмента визуализации Jupiterplot. Несмотря на то, что енотовидные собаки на 12 млн лет «моложе» волков, выяснилось, что у обоих видов существует сходство между структурой и составом геномов. Данная работа послужит для будущих исследований, которые включают ассоциацию генов с болезнями, изучение архитектуры хромосом, а также для работ по теории эволюции.
===========
Источник:
habr.com
===========
Похожие новости:
- [Научно-популярное, Физика] Нейтронные звезды могут быть больше, чем считалось ранее
- [Научно-популярное, Физика, Квантовые технологии, Астрономия] Квантовый эксперимент с двумя щелями даёт надежду на создание телескопа размером с Землю (перевод)
- [Научно-популярное, Космонавтика] Starlink L26 + Rideshare. Запуски года: 43 всего, 21 от США
- [Обработка изображений, Управление продажами, История IT, Научно-популярное] Штрих-код
- [Научно-популярное, Космонавтика] Авария Electron. Запуски года: 42 всего, 20 от США
- [Схемотехника, Производство и разработка электроники, Научно-популярное] Дисульфид молибдена назвали ключом в уменьшении двумерных транзисторов
- [Научно-популярное, Инженерные системы] Доктора в синем небе
- [Open source, Читальный зал, Научно-популярное, Краудсорсинг] Пришло время и тебе встать на защиту Sci-hub (перевод)
- [Научно-популярное, Космонавтика] Китайский Бог Огня уже на Марсе
- [Читальный зал, Дизайн, Научно-популярное, Лайфхаки для гиков] Как делают стул, который служит 150 лет и выдерживает попадание торпеды (перевод)
Теги для поиска: #_nauchnopopuljarnoe (Научно-популярное), #_biotehnologii (Биотехнологии), #_zhivotnye (животные), #_mlekopitajuschie (млекопитающие), #_genom (геном), #_rasshifrovka_genoma (расшифровка генома), #_zabolevanija (заболевания), #_koronavirus (коронавирус), #_nauchnopopuljarnoe (
Научно-популярное
), #_biotehnologii (
Биотехнологии
)
Вы не можете начинать темы
Вы не можете отвечать на сообщения
Вы не можете редактировать свои сообщения
Вы не можете удалять свои сообщения
Вы не можете голосовать в опросах
Вы не можете прикреплять файлы к сообщениям
Вы не можете скачивать файлы
Текущее время: 23-Ноя 00:48
Часовой пояс: UTC + 5
| Автор | Сообщение |
|---|---|
|
news_bot ®
Стаж: 6 лет 9 месяцев |
|
|
Исследователи из Политехнического университета Валенсии и Университета страны басков смогли аннотировать полный геном енотовидной собаки. Известно, что этот вид является переносчиком многих заболеваний, которые могут поражать человека, включая Covid-19.  Енотовидные собаки (Nyctereutes procyonoides), близкие родственники лисы (Vulpes vulpes) произошли из Восточной Азии, а в 1940-х годах были завезены в Европу. Хотя самые южные популяции, обнаруженные на данный момент, находятся во Франции, исследования предсказывают, что животные могут поселиться на Пиренейском полуострове в течение следующих 20 лет. Это имеет большое значение с точки зрения общественного здравоохранения, поскольку, как известно, енотовидная собака является переносчиком множества заболеваний, которые могут поражать людей, включая коронавирус. Для расшифровки генома использовались долгое секвенирование третьего поколения (PacBio и Oxford Nanopore Technologies) и методы биоинформатики. Основная проблема заключалась в сложной хромосомной структуре вида, которая характеризуется наличием необычно больших теломер и центромер, а также различного количества хромосом B-типа. Все эти элементы характеризуются некодирующими повторяющимися участками ДНК, которые очень трудно секвенировать и впоследствии изучать. Размер полученного генома составляет 2,39 гигабаз, в нем идентифицировано и аннотировано более 27 тысяч генов. Кроме того, 39 % собранного генома состоит из повторяющихся областей.  b) Естественный (оранжевый) и нынешний и прогнозируемый (фиолетовый) ареалы обитания енотовидной собаки. c) Рабочий процесс сборки и аннотации генома. d) График, показывающий глубину охвата генома считыванием, GC-состав и размер охвата. e) Синтения генома, полученная с помощью инструмента визуализации Jupiterplot. Несмотря на то, что енотовидные собаки на 12 млн лет «моложе» волков, выяснилось, что у обоих видов существует сходство между структурой и составом геномов. Данная работа послужит для будущих исследований, которые включают ассоциацию генов с болезнями, изучение архитектуры хромосом, а также для работ по теории эволюции. =========== Источник: habr.com =========== Похожие новости:
Научно-популярное ), #_biotehnologii ( Биотехнологии ) |
|
Вы не можете начинать темы
Вы не можете отвечать на сообщения
Вы не можете редактировать свои сообщения
Вы не можете удалять свои сообщения
Вы не можете голосовать в опросах
Вы не можете прикреплять файлы к сообщениям
Вы не можете скачивать файлы
Вы не можете отвечать на сообщения
Вы не можете редактировать свои сообщения
Вы не можете удалять свои сообщения
Вы не можете голосовать в опросах
Вы не можете прикреплять файлы к сообщениям
Вы не можете скачивать файлы
Текущее время: 23-Ноя 00:48
Часовой пояс: UTC + 5