[Научно-популярное, Биотехнологии] Необычная структура генома одного из видов планктона удивила учёных
Автор
Сообщение
news_bot ®
Стаж: 6 лет 9 месяцев
Сообщений: 27286
У одноклеточного планктона из группы динофлагеллятов оказался очень необычно организованный геном. Результаты научной работы, в которой принимали участие учёные из Саудовской Аравии, США и Германии, расширяет наше представление о том, как может выглядеть геном эукариотов.
Исследователи изучали строение генома кораллового симбионта Symbiodinium microadriaticum. Этот геном уже был секвенирован и собран в сегменты, т.н. скаффолды, но на уровне хромосом сборка ещё не проводилась.
Учёные использовали технику Hi-C, чтобы определить взаимодействие частей хроматина – комбинации ДНК и белков, составляющих хромосом. Таким образом они хотели понять, как скаффолды соединялись в хромосомы (определить их конформацию) как в пространственном, так и в структурном смысле.
Неожиданно оказалось, что гены планктона организовывались в виде перемежающихся однонаправленных блоков. По словам Октавио Салазара, постдока из Научно-технологический университета имени короля Абдаллы, одного из ведущих авторов исследования, такая структура кардинально отличается от всего, что можно наблюдать у других организмов. Обычно гены в хромосоме выстраиваются случайным образом. В данном же случае они были строго ориентированы то в одну, то в другую сторону, перемежаясь друг с другом, и границы блоков были чётко видны в данных по взаимодействию хроматинов.
Такая организация генома сказалась и на его трёхмерной структуре. Также интересно, что она, судя по всему, от транскрипционной активности. Когда исследователи обработали клетки химическим веществом, блокирующим транскрипцию генов, характерные структурные блоки исчезли.
Это, по-видимому, связано с тем фактом, что у данного планктона очень мало факторов, влияющих на транскрипцию, и они не реагируют на изменение окружающей среды изменением экспрессии генов. Пока непонятно, адаптируются ли они при помощи утери или приобретения хромосом, или при помощи эпигенетических модификаций структуры – учёные планируют выяснить это в дальнейшем.
Также неясно, откуда взялась такая необычная структура генома. Динофлагелляты используют очень мало гистонов, а вместо них применяют давно вошедшие в свой геном вирусные белки. Предстоит выяснить, есть ли связь между этими фактами.
Исследование показывает, что иногда ожидания и разные догмы, выработанные на основе изучения других эукариотов, дают сбой. Природа может работать совершенно не так, как предполагали учёные, и во время эволюции могло реализоваться очень много разных возможностей.
===========
Источник:
habr.com
===========
Похожие новости:
- [Ненормальное программирование, Научно-популярное] Самурай с мечом подобен самураю без меча или Где на самом деле ошибался Джигарханян?
- [Научно-популярное, Космонавтика, Мультикоптеры, Будущее здесь] Оператор «Индженьюити» подробно рассказал о фазах полета над поверхностью Марса
- [Научно-популярное, Космонавтика] Очередной шпион. Запуски года: 37 всего, 12 от Китая
- [Научно-популярное, Космонавтика, Будущее здесь] Марсианский рубеж (перевод)
- [Научно-популярное, Биотехнологии, Астрономия] На Марсе есть все условия для существования жизни под поверхностью планеты
- [Интернет-маркетинг, История IT, Научно-популярное] Как рекламщики уничтожили электронную почту, и что сейчас они делают с мобильной связью
- [Научно-популярное] Галлюцинации у мышей и как это связано с сумасшествием у людей?
- [Научно-популярное, Биотехнологии, Здоровье, Химия] Мухи в холодильнике: криоконсервация эмбрионов плодовой мушки
- [История IT, Научно-популярное, Старое железо] История электронной вычислительной техники в СССР
- [Научно-популярное, Физика, DIY или Сделай сам, Лайфхаки для гиков, Электроника для начинающих] Как выбрать самогонный аппарат!?
Теги для поиска: #_nauchnopopuljarnoe (Научно-популярное), #_biotehnologii (Биотехнологии), #_genom (геном), #_genetika (генетика), #_plankton (планктон), #_dnk (днк), #_nauchnopopuljarnoe (
Научно-популярное
), #_biotehnologii (
Биотехнологии
)
Вы не можете начинать темы
Вы не можете отвечать на сообщения
Вы не можете редактировать свои сообщения
Вы не можете удалять свои сообщения
Вы не можете голосовать в опросах
Вы не можете прикреплять файлы к сообщениям
Вы не можете скачивать файлы
Текущее время: 22-Ноя 08:00
Часовой пояс: UTC + 5
| Автор | Сообщение |
|---|---|
|
news_bot ®
Стаж: 6 лет 9 месяцев |
|
 У одноклеточного планктона из группы динофлагеллятов оказался очень необычно организованный геном. Результаты научной работы, в которой принимали участие учёные из Саудовской Аравии, США и Германии, расширяет наше представление о том, как может выглядеть геном эукариотов. Исследователи изучали строение генома кораллового симбионта Symbiodinium microadriaticum. Этот геном уже был секвенирован и собран в сегменты, т.н. скаффолды, но на уровне хромосом сборка ещё не проводилась. Учёные использовали технику Hi-C, чтобы определить взаимодействие частей хроматина – комбинации ДНК и белков, составляющих хромосом. Таким образом они хотели понять, как скаффолды соединялись в хромосомы (определить их конформацию) как в пространственном, так и в структурном смысле. Неожиданно оказалось, что гены планктона организовывались в виде перемежающихся однонаправленных блоков. По словам Октавио Салазара, постдока из Научно-технологический университета имени короля Абдаллы, одного из ведущих авторов исследования, такая структура кардинально отличается от всего, что можно наблюдать у других организмов. Обычно гены в хромосоме выстраиваются случайным образом. В данном же случае они были строго ориентированы то в одну, то в другую сторону, перемежаясь друг с другом, и границы блоков были чётко видны в данных по взаимодействию хроматинов. Такая организация генома сказалась и на его трёхмерной структуре. Также интересно, что она, судя по всему, от транскрипционной активности. Когда исследователи обработали клетки химическим веществом, блокирующим транскрипцию генов, характерные структурные блоки исчезли. Это, по-видимому, связано с тем фактом, что у данного планктона очень мало факторов, влияющих на транскрипцию, и они не реагируют на изменение окружающей среды изменением экспрессии генов. Пока непонятно, адаптируются ли они при помощи утери или приобретения хромосом, или при помощи эпигенетических модификаций структуры – учёные планируют выяснить это в дальнейшем. Также неясно, откуда взялась такая необычная структура генома. Динофлагелляты используют очень мало гистонов, а вместо них применяют давно вошедшие в свой геном вирусные белки. Предстоит выяснить, есть ли связь между этими фактами. Исследование показывает, что иногда ожидания и разные догмы, выработанные на основе изучения других эукариотов, дают сбой. Природа может работать совершенно не так, как предполагали учёные, и во время эволюции могло реализоваться очень много разных возможностей. =========== Источник: habr.com =========== Похожие новости:
Научно-популярное ), #_biotehnologii ( Биотехнологии ) |
|
Вы не можете начинать темы
Вы не можете отвечать на сообщения
Вы не можете редактировать свои сообщения
Вы не можете удалять свои сообщения
Вы не можете голосовать в опросах
Вы не можете прикреплять файлы к сообщениям
Вы не можете скачивать файлы
Вы не можете отвечать на сообщения
Вы не можете редактировать свои сообщения
Вы не можете удалять свои сообщения
Вы не можете голосовать в опросах
Вы не можете прикреплять файлы к сообщениям
Вы не можете скачивать файлы
Текущее время: 22-Ноя 08:00
Часовой пояс: UTC + 5